События девятого сезона стартуют с момента, когда Сэм оказывается на пороге смерти. Третье испытание практически уничтожило его внутренние органы, и врачи разводят руками. Дин в отчаянии отправляется в церковь, готовый молиться кому угодно. Его мольбу слышит ангел Иезекииль, который соглашается помочь в обмен на будущую услугу. Однако за этой помощью скрывается нечто большее. Иезекииль вселяется в тело Сэма, и брат, сам того не зная, становится сосудом для падшего ангела.
Небеса переживают катастрофу. Тысячи ангелов падают на Землю, лишённые крыльев и возможности вернуться. Многие разбиваются, другие не могут найти сосуд и умирают. Уцелевшие делятся на враждующие фракции, а Кастиэль оказывается в самом тяжёлом положении. Он потерял не только крылья, но и благодать, став обычным человеком, который чувствует голод, холод и усталость. Вдобавок на него объявлена охота, и каждый ангел мечтает свести с ним счёты.
На другом фронте разгорается борьба за власть в аду. Абаддон, один из рыцарей ада, жаждет занять трон Кроули. Она распускает слухи о его смерти и пытается перетянуть демонов на свою сторону. Но Кроули жив и находится в плену у Винчестеров. Дин узнаёт, что уничтожить Абаддон можно только специальным клинком, и ради его получения он вынужден заключить сделку с самим королём ада. Такие сделки редко заканчиваются добром. Девятый сезон становится поворотным моментом, где каждое решение героев имеет далеко идущие последствия.